安徽农业科学

2009, v.37;No.269(16) 7355-7358+7360

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鲈形目线粒体DNA蛋白编码基因的适用性分析
Application Analysis of Mitochondrial DNA Protein-coding Gene among Perciformes

郭昱嵩;王中铎;焦阳;刘楚吾;

摘要(Abstract):

[目的]对线粒体DNA 13种蛋白质编码基因的系统进化分析能力进行了评估。[方法]单个基因和基因拼接序列比较,综合考虑序列的信息量和邻位连接法构建系统进化树的置信度。[结果]按分类阶元不同将基因都分成不同的4等。在鲈形目的科间阶元,最好的为ND6和cox2;好的序列为ND5和ND4;ND4L、ND3和ATP8差;包括Cyt b、cox1在内的其余6种基因为中等;在属内种间阶元,最好的为ATP6和cox2;好的序列为ND2和cox1;ND6、ND3和ATP8差;包括Cyt b在内的其余6种基因为中等。另外,分析揭示序列长度的增加可以提高系统进化树的置信度,且属内物种间比较时序列长度的影响小于高级阶元。[结论]线粒体DNA蛋白质编码基因的信息分布具不均一性,需分类阶元选择最佳基因和组合。

关键词(KeyWords): 鲈形目;线粒体DNA;蛋白编码基因;系统进化

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金资助项目(30671610);; 国家科技支撑计划项目(2007BAD29B03)

作者(Author): 郭昱嵩;王中铎;焦阳;刘楚吾;

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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2009.16.142

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