安徽农业科学

2019, v.47;No.630(17) 103-107+110

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十字花科植物DFR蛋白的生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of DFR Proteins in Cruciferae Plant

胡燕;尹明智;匡光炼;黄杰;严秋香;

摘要(Abstract):

采用生物信息学的方法分析已经在GenBank上注册十字花科植物的DFR基因序列及相应氨基酸序列,并对其理化性质、结构特征、系统进化关系等进行预测。结果表明,十字花科植物的DFR蛋白大部分都有6个外显子,分子质量36 481.89~43 129.21 Da,大多数蛋白亚细胞定位于叶绿体中;除了BnaDFRA402,其他的DFR蛋白均具有酶活性部位、NADP结合位点和底物特异结合位点,这些保守区域形成了5个motifs;每个DFR蛋白均有多个磷酸化位点,以Ser为主,以Thr和Tyr磷酸化为辅;二级结构均由α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲组成,其中α-螺旋为主要结构元件。

关键词(KeyWords): 十字花科;花青素;DFR蛋白;生物信息学

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金项目(31501337);; 贵州省科学技术厅、遵义市科学技术局、遵义师范学院联合科技基金项目(黔科合LH字[2016]7014号);; 贵州省高层次创新型人才培养计划(遵市科合人才[2017] 11号);; 贵州省高等学校创新能力提升计划(黔教合协同创新字[2013]11)

作者(Author): 胡燕;尹明智;匡光炼;黄杰;严秋香;

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参考文献(References):

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