安徽农业科学

2017, v.45;No.570(29) 149-152

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黄芪甲基化敏感扩增多态性(MSAP)扩增引物筛选及初步应用
Primer Screening and Preliminary Application of MSAP for Radix astragali

宗凯;赵营莉;周莉质;李秀秀;宫鹏;夏泉;

摘要(Abstract):

[目的]建立并优化黄芪甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术扩增反应体系,对中药材黄芪甲基化水平进行研究。[方法]磁珠法提取黄芪DNA后,采用Hpa II/Msp I 2种内切酶进行酶切,将酶切产物加上连接接头序列,经预扩增和选择性扩增反应,最终从黄芪MSAP的256对引物中筛选出最佳分辨引物4对。应用筛选到的4对引物,分析12种不同产地黄芪的甲基化模式,并对甲基化水平聚类分析。[结果]经MSAP检测12个黄芪样本半甲基化率在12.5%~26.7%,全甲基化率在25.6%~51.1%,总甲基化率在48.7%~73.5%,总体上黄芪样本的全甲基化率大于半甲基化率。采用NTSYSpc软件对黄芪样品Hpa II和Msp I多态性数据进行分析,获得UPGMA聚类图和主成分分析PCA图。[结论]MSAP技术能够很好地用于黄芪的甲基化分析,结合NTSYSpc软件能对不同产地黄芪之间甲基化水平进行聚类分析,且初步分析结果表明从UPGMA和PCA图上来看,地区相近的单株聚类分析表现出了一定的地域性。

关键词(KeyWords): 黄芪;甲基化敏感扩增多态性;选择性扩增;聚类分析

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家质检总局科技计划项目(2015IK001)

作者(Author): 宗凯;赵营莉;周莉质;李秀秀;宫鹏;夏泉;

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参考文献(References):

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