安徽农业科学

2010, v.38;No.311(22) 11719-11721+11724

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柑橘类植物SOD基因片段的克隆和SNP分析
Cloning of SOD Gene Segments and SNP Analysis in Citrus

吴波;刘勇;

摘要(Abstract):

[目的]对柑橘类植物遗传多样性进行精确分析研究。[方法]根据已报道的各种植物Mn/Fe-SOD基因的氨基酸序列上前后2个保守区设计1对简并引物,采用RT-PCR技术,分别从岭南沙田柚、柠檬等6种柑橘类植物中克隆得到长426bp的Mn/Fe-SOD基因片段,并对所得序列进行了SNP分析。[结果]柑橘类植物核苷酸同源性高达97.2%,与其他植物Mn/Fe-SOD基因核苷酸序列的同源性都在77.7%以上;经过氨基酸序列推导,每个基因片段分别编码142个氨基酸,6个基因片段的氨基酸同源性为97.9%,与其他植物Mn/Fe-SOD基因的氨基酸序列同源性在79.0%以上。在Mn/Fe-SOD基因片段中有18个核苷酸位点存在SNPs,导致3个氨基酸位点发生变异,多态性频率为1SNP/23.7bp,核苷酸变异度为4.23%,氨基酸变异度为2.38%。[结论]该研究为丰富构建柑橘类植物基因图谱标记和抗逆性状的遗传标记奠定了基础。

关键词(KeyWords): 柑橘类植物;SOD;基因克隆;SNP;序列分析

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 江西省自然科学基金项目(2009GZN0024);; “产学研”结合培养高素质复合型中药人才模式创新研究与实践项目(教高函〔2007〕29号);; 江西农业大学博士启动基金项目(1791)

作者(Author): 吴波;刘勇;

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