普通牛CAPN10基因生物信息学分析Bioinformatics Analysis of CAPN10 Gene in Cattle
张青兰;
摘要(Abstract)：
从GenBank中获得普通牛CAPN10基因CDs序列,对其核苷酸序列和编码蛋白序列及其蛋白结构进行生物信息学分析,结果表明,普通牛CAPN10蛋白编码640个氨基酸残基,相对分子质量70.42 kD,理论等电点(pI)8.02,其氨基酸序列中存在较强的亲水区域,二级结构以α-螺旋和无规卷曲为主的混合型。
关键词(KeyWords)： 普通牛;CAPN10基因;CDs区;生物信息学
基金项目(Foundation):
作者(Author): 张青兰;
Email:
DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2013.16.119
参考文献(References)：
- [1]SORIMACHI H,ISHIURA S,SUZUKI K.Structure and physiological func-tion of calpains[J].Biochemical Journal,1997,328(3):721-732.
- [2]CARAFOLI E,MOLINARI M.Calpain:a protease in search of a function?[J].Biochem Biophy Res Commun,1998,247:193-203.
- [3]SORIMACHI H,ONO Y.Regulation and physiological roles of the calpain sys-tem in muscular disorders[J].Cardiovascular Research,2012,96(1):11-22.
- [4]SORIMACHI H,IMAJOH-OHMI S,EMORI Y.Molecular cloning of a novelmammalian calcium-dependent protease distinct from both m-and mu-type:specific expression of the mRNA in skeletal muscle[J].Biological Chemis-try,1989,264(33):20106-20111.
- [5]邓梅香,陈军建,俞力,等.钙蛋白酶10基因多态性与体重和胰岛素抵抗的相关性[J].现代预防医学,2008,35(22):4467-4468.
- [6]董靖,彭惠民.CAPN10基因单核苷酸多态性与西南地区人群2型糖尿病的相关性研究[J].重庆医科大学学报,2008,33(12):1475-1478.
- [7]杨秀芹,关庆芝,于浩,等.野猪CAPN10基因两个剪接变异体的克隆、序列分析和表达[J].畜牧兽医学报,2009,40(11):1609-1614.
- [8]SURINYA K H,COX T C,MAY B K.Identification and characterization of aconserved erythroid-specific enhancer located in intron 8 of the human 5-ami-nolevulinate synthase 2 gene[J].J Biol Chem,1998,273(27):16798-16809.
- [9]GURUPRASAD K,REDDY B,PANDIT M.Correlation between stability ofa protein and its dipeptide composition:a novel approach for predicting invivo stability of a protein from its primary sequence[J].Protein Eng,1990,4:155-161.
- [10]潘红梅,罗玉柱,胡江,等.牦牛CAPN3基因CDS区克隆及生物信息学分析[J].甘肃农业大学学报(已接收)
- [11]KYTE J,DOOLITTLE R.A simple method for displaying the hydropathiccharacter of a protein[J].J Mol Biol,1982,157:105-132.
- [12]徐飞,成述儒,罗玉柱.奶牛DRB1基因生物信息学分析[J].生物技术通报,2011(1):113-117.
- [13]张卓然,倪语星,洪秀华,等.临床微生物学和微生物检验[M].3版.北京:人民卫生出版社,2003:458-460.
- [14]任林,陈趟群,吴移谋,等.血培养病原菌菌群分布及耐药分析[J].中国抗生素杂志,2005,30(7):407-4l1.
- [15]王辉,张悦娴,谢秀丽,等.血培养凝固酶阴性葡萄球菌阳性的临床意义[J].中国抗感染化疗杂志,2001,1(2):79-82.
- [16]孙红霞,张奎星,杜玮南,等.中国人CAPN10基因单核苷酸多态性的分布及其在北方汉族2型糖尿病人群中的关联分析[J].中国医学科学院学报,2002,24(3):228-232.
- [17]陈恕凤,严卫丽,王来元,等.CAPN10基因变异与中国北方汉族人群血脂水平的关联研究[J].中国分子心脏病学杂志,2009,9(3):129-133.
- [18]张丽.牦牛CAPN3、CAPN4和H-FABP基因分子遗传特征及其与胴体和肉质性状关联研究[D].兰州:甘肃农业大学,2013.
- [19]段立华,张仁利,张力勇.日本血吸虫钙蛋白酶肽链文库的制备及其B细胞表位的筛选[J].中华微生物学和免疫学杂志,2002,22(4):411-414.
- [20]徐国恒.二硫键与蛋白质的结构[J].生物学通报,2010,45(5):5-7.