安徽农业科学

2017, v.45;No.552(11) 117-118

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动物双歧杆菌AD011表面脂蛋白的全基因组预测和功能分析
Genome-wide Prediction and Functional Analysis of Surface Lipoproteins of Bifidobacterium animalis AD011

栗金柳;王茗悦;朱德全;高峰;于陆雪子;周金影;郝莹莹;张宛麟;周博;

摘要(Abstract):

[目的]运用生物信息学方法预测动物双歧杆菌AD011定位于细胞膜的表面脂蛋白,为后续研究该菌与宿主相互作用的分子机制提供基础资料。[方法]用Signal P 4.0和Lipo P软件对动物双歧杆菌AD011全基因组编码蛋白中表面脂蛋白和信号肽进行预测,同时采用COG功能数据库对预测的脂蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]对动物双歧杆菌AD011基因组1 518个蛋白的表面脂蛋白预测,结果表明,19个蛋白具有脂蛋白信号肽。功能分析显示,该菌株19个脂蛋白中有3个蛋白没有功能注释,16个蛋白有功能注释,其中10个蛋白参与氨基酸代谢与转运、3个蛋白参与碳水化合物代谢与转运,3个蛋白参与无机盐离子代谢与转运。[结论]动物双歧杆菌AD011表面脂蛋白参与的功能主要与营养物质的转运和代谢有关。

关键词(KeyWords): 动物双歧杆菌;基因组;脂蛋白;信号肽

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 黑龙江大学生创新创业项目(201610222059);; 佳木斯大学大学生科技创新项目(xsyz2016-02);; 黑龙江省卫生计生委科研项目(2016-325)

作者(Author): 栗金柳;王茗悦;朱德全;高峰;于陆雪子;周金影;郝莹莹;张宛麟;周博;

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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2017.11.037

参考文献(References):

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