安徽农业科学

2012, v.40;No.364(03) 1300-1303

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毛果杨1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-二磷酸合酶(HDS)基因的生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of 4-hydroxy-3-methyl-2-buten1yl diphosphate synthase (HDS) in Populus trichocarpa

刘立辉;李成浩;杨静莉;夏德安;

摘要(Abstract):

[目的]研究HDS基因间的同源性及其进化关系。[方法]以毛果杨的HDS基因为研究对象,利用生物信息学软件及网站对其进行碱基分布、氨基酸组成、亲疏水性、保守区以及二级结构和三级结构的预测与分析。,并与其他10个物种的HDS基因序列进行多重比对与进化分析。[结果]毛果杨HDS基因的单链mRNA序列长1 956 bp,编码由656个氨基酸组成的蛋白质,该蛋白质相对分子质量为72 937.03,其中含量最高的是Leu,为10.50%;整个多肽中疏水性氨基酸只占39.63%,有10个亲水区和6个疏水区;与其他10个物种同源性多重比对发现同源性最高达99%。[结论]毛果杨HDS基因处于稳定状态,编码的蛋白为亲水性蛋白,在进化过程中是保守的;试验中获得的保守区段序列信息为新基因的克隆奠定了基础。

关键词(KeyWords): HDS;毛果杨;生物信息学;萜类

Abstract:

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基金项目(Foundation):

作者(Author): 刘立辉;李成浩;杨静莉;夏德安;

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