安徽农业科学

2010, v.38;No.305(16) 8303-8307+8311

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棉花乙烯受体基因的电子克隆及生物信息学分析
In Silico Cloning and Bioinformatics Analysis on Ethylene Receptor Gene from Cotton

潘玉欣;穆晓阳;

摘要(Abstract):

[目的]电子克隆并分析棉花乙烯受体基因(Ethylene Receptor,ETR)。[方法]利用生物信息学方法,以毛果杨的ETR基因家族序列为基础,电子克隆棉花乙烯受体基因开放阅读框,并对序列进行氨基酸组成、功能域、二级结构、疏水性、信号肽及系统进化等预测分析。[结果]通过电子拼接,共获得该基因家族的2个棉花ETR基因GhETR1和GhETR2。2个基因开放阅读框长度分别为2 289 bp和2 226 bp,编码含762和741个氨基酸残基的肽链。经生物信息学分析发现,两基因分属于ETR2和ETR1亚家族。N端有典型的跨膜区,含有ETR蛋白的保守域GAF、H isKA、HATPase-c和REC。GhETR1与毛果杨XP_002315717、XP_002311669相似性较高,GhETR2与毛果杨XP_002299688、XP_002327419相似性较高。[结论]该研究结果为进一步研究棉花GhETR基因在棉纤维发育中的作用奠定了基础。

关键词(KeyWords): 棉花;乙烯受体基因;电子克隆;生物信息学

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation):

作者(Author): 潘玉欣;穆晓阳;

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