安徽农业科学

2017, v.45;No.550(09) 129-131

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两歧双歧杆菌PRL2010细胞壁蛋白预测和功能分析
Prediction and Functional Analysis of Cell Wall Proteins of Bifidobacterium bifidum PRL2010

朱德全;王茗悦;张跃华;姚嘉;韩诚武;卢伟;栾积毅;邢蕾;刘向东;

摘要(Abstract):

[目的]运用生物信息学方法预测两歧双歧杆菌PRL2010锚定于细胞壁的蛋白和功能分析,为后续研究该菌与宿主相互作用的分子机制奠定基础。[方法]用Phobius和Signal P 4.0软件对两歧双歧杆菌PRL2010全基因组编码蛋白中细胞壁蛋白进行预测,同时采用COG(Cluster of Orthologous Groups of proteins)功能数据库对预测的细胞壁蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]两歧双歧杆菌PRL2010基因组1 706个编码蛋白中,28个蛋白含有细胞壁的锚定结构域。细胞壁蛋白功能分析结果显示,28个细胞壁蛋白中,21个蛋白没有功能注释,7个蛋白有功能注释,其中1个蛋白(exo-alpha-sialidase)参与碳水化合物代谢与转运,2个蛋白(bacteriophage endolysin和cell wall-associated protein)参与细胞壁和细胞膜的生物合成,2个蛋白(hypothetical protein BBPR_0440和Subtilisin family peptidase)参与蛋白质翻译后修饰,1个蛋白(beta-n-acetylhexosaminidase Nag Z)参与细胞内运输、分泌和囊泡运输,1个蛋白(metallophosphoesterase)功能只是预测的。[结论]两歧双歧杆菌PRL2010的大多数细胞壁蛋白功能未知,还需要在以后的研究中进一步分析和注释。

关键词(KeyWords): 两歧双歧杆菌;基因组;细胞壁蛋白;功能

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 黑龙江省卫生计生委科研项目(2016-325);; 佳木斯大学科技创新团队项目(cxtd-2016-02)

作者(Author): 朱德全;王茗悦;张跃华;姚嘉;韩诚武;卢伟;栾积毅;邢蕾;刘向东;

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