安徽农业科学

2017, v.45;No.571(30) 128-130+163

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枯草芽孢杆菌subtilis str.168双精氨酸途径分泌蛋白预测及功能分析
Prediction and Functional Analysis of Secreted Proteins of Twin-Arginine Translocation Pathway in Bacillus subtilis subsp. subtilis str.168

朱德全;韩诚武;尹红;张路路;白雪;姚嘉;邢雷;张跃华;卢伟;栾积毅;刘向东;

摘要(Abstract):

[目的]对枯草芽孢杆菌subtilis str.168双精氨酸转运途径(Tat)分泌蛋白进行预测和功能分析。[方法]从NCBI中选取枯草芽孢杆菌subtilis str.168基因组注释的蛋白质氨基酸序列,然后用Signal P 4.0、Lipo P、Tat P、TMHMM 2.0软件分析该基因组中双精氨酸途径的分泌蛋白,同时采用COG功能数据库对预测的分泌蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]通过分析发现108个有motif没有酶切位点的Tat信号肽蛋白、25个有酶切位点没有motif的Tat信号肽蛋白、124个既有酶切位点也有motif的Tat信号肽蛋白,其中105个蛋白归为Tat途径的分泌蛋白。[结论]对枯草芽孢杆菌Tat途径分泌蛋白的基因组预测和功能分析,将为分析该菌胞外蛋白的分泌机制打下基础。

关键词(KeyWords): 枯草芽孢杆菌;分泌蛋白;双精氨酸分泌途径;功能分析

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 黑龙江省教育厅科研项目(2016-KYYWF-0544)

作者(Author): 朱德全;韩诚武;尹红;张路路;白雪;姚嘉;邢雷;张跃华;卢伟;栾积毅;刘向东;

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