安徽农业科学

2011, v.39;No.329(04) 1980-1983+2004

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广州桑树矮缩病植原体secE基因序列分析与蛋白结构预测
Analysis of secE Gene Sequence from Phytoplasma Associated with Mulberry Dwarf Disease in Guangzhou and Prediction of its Protein Structure

胡小华;张丽君;罗焕亮;张毅;

摘要(Abstract):

[目的]预测广州桑树矮缩病植原体secE蛋白的抗原性。[方法]应用PCR技术从典型矮缩症状的桑树植株总DNA中扩增到约400 bp的特异片段,将此片段克隆后与GeneBank中已报道的5种植原体的secE基因进行序列同源性分析,并对克隆基因所编码的蛋白进行理化性质、二级结构、跨膜区以及前导信号序列分析。[结果]该片段长411 bp,编码136个氨基酸的蛋白。桑树矮缩植原体与洋葱黄化植原体同源性最高,核苷酸和编码的氨基酸序列同源率分别为100%和99%。secE蛋白理化性质预测其理论等电点为9.33;二级结构主要为螺旋,其次为折叠和无规则卷曲,无转角;有3个明显的疏水区,易形成跨膜螺旋;有4个明显的抗原区域。[结论]该secE蛋白具有良好的抗原性。

关键词(KeyWords): 广州桑树矮缩病;植原体;SecE基因;同源性;蛋白结构

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 深圳市基础研究计划项目(JC200903180710A)

作者(Author): 胡小华;张丽君;罗焕亮;张毅;

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参考文献(References):

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