安徽农业科学

2015, v.43;No.503(34) 207-210

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雷州黑鸭PID1基因部分序列的克隆与蛋白功能分析
Analysis of Cloning and Protein Function of Partial PID1 Gene Sequence of Leizhou Black Duck

黄汉光;汤绮明;苏瑛;许冲;崔红艳;常羽;黄骏腾;

摘要(Abstract):

[目的]了解雷州黑鸭磷酸酪氨酸互作结构域1(phosphotyrosine interaction domain containing 1,PID 1)基因的序列结构特征及其蛋白的功能,为利用其改善雷州黑鸭肉品质与提高肉风味提供分子理论依据。[方法]采用RT-PCR方法克隆雷州黑鸭PID1基因部分序列,测序后比对其同源性,构建系统发育树,并预测其蛋白结构与功能。[结果]该核苷酸序列长度为369 bp,编码80个氨基酸,且大多为疏水性氨基酸。与人、牛、鸡等物种进行同源性比对,发现雷州黑鸭PID1基因序列与鸡具有高度同源性,同源性高达94%,且雷州黑鸭与鸡聚于同一系统发育支。蛋白质结构预测表明,该蛋白无跨膜结构与信号肽,氨基酸序列呈疏水性,位于细胞质中。[结论]雷州黑鸭的PID1基因与鸡的亲缘关系最近,其蛋白主要功能是在细胞质中参与肌内脂肪沉积的调控。

关键词(KeyWords): 雷州黑鸭;PID1;克隆;蛋白功能分析

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 广东省科技计划项目(2014A020208123);; 广东星火计划项目(2012A020602104);; 湛江市科技计划项目(2012C0204湛科[2012]86号);; 广东海洋大学博士启动基金项目(1212040);广东海洋大学研究生示范课程培育项目(11)

作者(Author): 黄汉光;汤绮明;苏瑛;许冲;崔红艳;常羽;黄骏腾;

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