山葡萄北冰红VvCOR413-I1基因克隆及生物信息学分析Cloning and Bioinformatic Analysis of VvCOR413-I1 Gene from Beibinghong Amur Grape
王学娟;
摘要(Abstract):
[目的]从山葡萄北冰红中克隆耐寒基因COR413,并对其功能进行生物信息学分析。[方法]利用RT-PCR法克隆山葡萄北冰红基因COR413,并利用生物信息学对其进行分析。[结果]它包括630 bp完整的开放阅读框,推测编码210个氨基酸,蛋白的分子量(MW)为59.18 k D,等电点(p I)值为10.74。其蛋白结构以α-螺旋、延伸链为主,其次为无规则卷曲,β-转角所占比例最少,含有4个跨膜结构域。多重序列比对表明VvCOR413-I1与其他植物COR413的氨基酸序列相似性为63.00%~68.33%。[结论]该研究为深入了解VvCOR413-I1功能奠定了基础。
关键词(KeyWords): 冷适应蛋白基因(COR413);山葡萄北冰红;克隆;生物信息学分析
基金项目(Foundation): 内蒙古民族大学科学研究项目(NMDYB17152)
作者(Author): 王学娟;
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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2018.14.031
参考文献(References):
- [1]龚映雪.植物响应温度胁迫蛋白质组学研究进展[J].安徽农业科学,2010,38(32):18038-18040.
- [2]缪嘉航.植物COR抗寒基因的转入研究[J].生物技术世界,2016(5):35,38.
- [3]黄永会,刘永翔,朱英,等.COR基因在植物抗寒基因工程中的作用[J].贵州农业科学,2014,42(12):37-42.
- [4]李志友.COR和CBF3基因导入番茄的研究[D].重庆:西南大学,2007.
- [5]陆艳梅,张金文,魏玉洁,等.罂粟COR和BBE基因RNAi载体构建及烟草转化[J].药学学报,2013,48(7):1169-1177.
- [6]张腾国,郭艳峰,陈琼琼,等.油菜COR基因的克隆及原核表达[J].甘肃农业科技,2015(4):1-4.
- [7]李良.播娘蒿抗寒基因COR的克隆及其生物信息学分析与表达研究[D].成都:四川大学,2005.
- [8]吴楚,王政权.拟南芥中CBF对COR基因表达的调控[J].植物生理学通讯,2001,37(4):365-368.
- [9]丁小玲,张宁波,焦淑珍,等.山葡萄COR413家族基因克隆及其参与低温胁迫的表达分析[J].农业生物技术学报,2017,25(3):366-377.