安徽农业科学

2010, v.38;No.297(08) 4112-4114+4125

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苹果锈果类病毒RNA序列的生物信息学分析
Analysis of the Biological Information of the RNA Sequence of Apple Rust Fruit-like Virus

陈建刚;王海波;

摘要(Abstract):

[目的]为苹果锈果类病毒结构域功能的关系、复制机制、变异与进化的研究提供理论依据。[方法]应用生物信息学的方法,得到一系列苹果锈果类病毒的RNA序列,对比其核苷酸数目、碱基组成比例,并进行了多重系列对比及二级结构预测。[结果]来自不同地区的苹果锈果类病毒RNA和核苷酸数目分布在329~336bp。其中核苷酸数为330bp的种类占64.71%,其A的分布范围19.39%~20.61%,T的分布范围在18.79%~20.91%,G的分布范围在29.70%~30.61%,C的分布范围在30.00%~30.91%。用RNAstructure软件进行苹果锈果类病毒的二级结构预测,随着稳定能量级的逐渐增加,其碱基配对区逐渐减小,而茎环区却逐渐增加。[结论]RNA是生物生命活动不可或缺的重要生物大分子,其二级结构比一级结构具有更大的保守性。

关键词(KeyWords): 类病毒;苹果锈果类病毒;生物信息学分析

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 曲靖师范学院科学研究基金项目(2008MS016)

作者(Author): 陈建刚;王海波;

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参考文献(References):

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