安徽农业科学

2009, v.37;No.286(33) 16263-16267+16288

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紫花苜蓿蛋白质二硫键异构酶mPDI的生物信息学分析与同源建模
Bioinformatics Analysis and Homology Modeling Study of Protein Disulfide Isomerase (mPDI) from Medicago sativa L.

王海波;施晓东;张梅芬;郭俊云;

摘要(Abstract):

紫花苜蓿蛋白质二硫键异构酶的基因已经被克隆测序。利用其mRNA及氨基酸序列,应用生物信息学软件预测了该蛋白质的理化性质、亲/疏水性、信号肽、二级结构、卷曲螺旋结构、跨膜区域、糖基化位点、活性位点、亚细胞定位、功能结构域及高级结构。结果表明,该蛋白质是一个整体疏水性蛋白,细胞定位为粗面内质网,含有512个氨基酸,理论等电点为4.98,信号肽位于1~24号氨基酸;二级结构中α-螺旋占26.37%(135AA),无规则卷曲占53.32%(273AA),延伸链占20.31%(104AA);包含3个卷曲螺旋结构,3个糖基化位点,2个硫氧还蛋白结构域,2个硫氧还蛋白活性位点。Ramachandram结构检测表明此模型的三维结构符合立体化学能量规则。

关键词(KeyWords): 紫花苜蓿;蛋白质二硫键异构酶;同源建模

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 曲靖师范学院校内青年科研基金项目(2008QN031)

作者(Author): 王海波;施晓东;张梅芬;郭俊云;

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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2009.33.082

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