安徽农业科学

2011, v.39;No.341(16) 9676-9679+9722

[打印本页] [关闭]
本期目录(Current Issue) | 过刊浏览(Past Issue) | 高级检索(Advanced Search)

适用变性梯度凝胶电泳分析的石油污染土壤微生物DNA模板制备的研究
DNA Preparation for Analyzing Petroleum Contaminated Soil Microorganism by Denaturing Gradient Gel Electrophoresis(DGGE)

韦超英;杨滨银;方新湘;娄恺;晁群芳;

摘要(Abstract):

[目的]为了快速、简便和经济地获得理化性质不同的石油污染土壤中微生物总DNA,以用于后续微生物群落结构分析及动态监测。[方法]采用3种提取方法对石油污染土壤中细菌总DNA进行提取,并通过DNA产量、纯度、片段大小、基因组完整性等对提取得到的DNA质量进行评价;并对16S rDNAV3可变区的PCR扩增产物进行DGGE分析。[结果]采用3种方法均能从石油污染土壤中提取得到相应的细菌DNA片段,且针对同一种提取方法,土壤理化性质的差异对DNA提取效果影响不明显,但不同方法提取得到的DNA在浓度和纯度上存在明显差异。采用3种方法提取得到的DNA量分别可达98.3、79.9和43.8 ng/μl。[结论]选取方法1提取基因组DNA并进一步纯化,纯化后的DNA分别采用引物F27/R1492和F357/R518进行16S rDNA及116S rDNAV3可变区的扩增,获得了条带清晰、浓度高、无污染的DNA目的片段;对其PCR扩增产物进行DGGE分析,得到的DGGE图谱可直观反应石油污染土壤中微生物的多样性及优势种群。

关键词(KeyWords): DNA提取;石油污染土壤;DGGE

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金项目(30960089)

作者(Author): 韦超英;杨滨银;方新湘;娄恺;晁群芳;

Email:

DOI:

参考文献(References):

扩展功能
本文信息
服务与反馈
本文关键词相关文章
本文作者相关文章
中国知网
分享