新疆野猪mtDNA控制区序列遗传多样性分析Genetic Diversity Analysis of mtDNA Control Region Sequence in Xinjiang Wild Pig
韩春梅;高庆华;赵书红;龚慧婷;赵余;
摘要(Abstract)：
[目的]为研究猪种起源和遗传分化提供依据。[方法]从6个新疆野猪样本中提取基因组DNA,克隆线粒体DNA控制区序列并进行测序。在测定新疆野猪与其他20个国内外猪种间的遗传距离的基础上,对其进行聚类分析。[结果]通过PCR扩增克隆到大小为1398bp的DNA片段,其A+T含量为59.87%,有明显的碱基偏向性。控制区内存在大量的ACACGTGCGT串联重复序列。在6个新疆野猪样本中检测到3个单倍型。群体平均单倍型多样度(H)为0.600,核苷酸多样度(π)为0.00086。聚类分析结果表明新疆野猪与滇南小耳猪、泰国野猪和藏猪具有较近的遗传关系。[结论]新疆野猪与亚洲野猪和中国地方猪种有较近的遗传关系。
关键词(KeyWords)： 新疆野猪;mtDNA控制区序列;遗传多样性
基金项目(Foundation): 新疆兵团重点实验室项目(编号HS200406)
作者(Author): 韩春梅;高庆华;赵书红;龚慧婷;赵余;
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参考文献(References)：
- [1]蒋思文,熊远著.中国地方猪种与瑞典猪种单倍型和种系发生关系的分析[A].全国动物遗传育种学术年会,2003:102-107.
- [2]KIM K I,LEE J H,LI K,et al.Phylogenetic relationships of Asian and European pig breeds determined by mitochondrial DNA D-loops equence polymorphism[J].Animal Genetics,2002,33:19-25.
- [3]YANG J,WANG J,KIFAS J,et al.Genetic diversity present within the near-completemt DNA genome of17breeds of indigenous chinese pigs[J].Journal of Heredity,2003,94(5):381-385.
- [4]GIUFFRA E,KIJAS J M H,AMARGER V,et al.The origin of the domestic pig:Independent domestication and subsequent Introgres-sion[J].Genetics,2000,154:1785-1791.
- [5]ALVES E,OVILO C,RODR M C,et al.Mitochondrial DNA sequence variation and phylogenetic relationships among Iberian pigs and other domestic and wild pig populations[J].Animal Genetics,2003,34:319-324.
- [6]HUANG Y F,SHI X W,ZHANG Y P.Mitochondrial genetic variation in Chinese pigs and wild boars[J].Biochemical Genetics,1999,37:335-343.
- [7]管松,何晓红,浦亚斌,等.中国西南地区5个地方绵羊群体mtDNA遗传多样性及系统进化研究[J].畜牧兽医学报,2007,38(3):219-224.
- [8]兰宏,王文,施立明.西南地区家猪和野猪mtDNA遗传多样性[J].遗传学报,1995,22(1):28-33.