安徽农业科学

2008, (12) 5020-5021+5027

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昆虫纲与线虫纲miRNAs碱基组成特征分析
Analysis on Characteristic of Base Composition of miRNA in Insecta and Rhabditida

朱善良;许琴;许晓风;

摘要(Abstract):

[目的]为全面认识miRNA的结构属性和miRNA基因识别策略的设计提供帮助。[方法]利用miRNA数据库,借助于相关的生物信息学软件和数据统计软件,对昆虫纲与线虫纲部分物种(黑腹果蝇、暗果蝇、西方蜜蜂、冈比亚疟蚊、秀丽线杆线虫、线虫种)的已知miRNA序列的碱基组成进行统计分析。[结果]6种生物的miRNA序列中,腺嘌呤(A)含量较为稳定,在碱基组成上AU含量高于GC含量。比较同一物种pre-miRNA与mat-miRNA间相同碱基含量发现,除黑腹果蝇pre-miRNA与mat-miRNA在胞嘧啶(C)的含量上存在显著差异外,其余均未见显著差异。[结论]推测miRNA碱基组成上AU含量高可能与其调控基因表达功能和物种的进化关系有关。

关键词(KeyWords): miRNA;碱基含量;生物信息学

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 高等学校博士学科点专项科研基金项目(20050319009);; 江苏教育学院学术带头人培养基金项目(94901)

作者(Author): 朱善良;许琴;许晓风;

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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2008.12.036

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