香稻品种遗传多样性研究Study on Genetic Diversity in Aromatic Rice
陈远孟;张向军;陈传华;杨新庆;李杨瑞;李容柏;
摘要(Abstract):
利用SSR分子标记分析78份外引香稻品种、18份在广西种植的香稻品种以及24份具有代表性的非香的广西地方栽培稻种质资源的遗传多样性,检测到100条多态性片段,每个引物可检测到3~14个多态性片段,平均为6.25个。聚类结果表明:利用16个SSR标记可以明显地把香稻与非香稻品种聚类为2大类;在78份外引香稻种质中,在遗传距离分别为0.64和0.56处,43份和14份各自聚为一类,占73.1%,18份与广西种植的香稻品种聚类,占23.1%,3份与非香的栽培稻品种聚为一类,占3.8%。不同类组香稻的Nei’s遗传距离估算表明,传统的南亚香稻的遗传多样性显著大于改良的南亚香稻,改良的南亚香稻的多样性又显著大于广西当前种植的香稻种质和广西代表性的非香稻种质。
关键词(KeyWords): 香稻;SSR;聚类分析;遗传距离
基金项目(Foundation): 广西区青年基金资助(桂科青0339014)
作者(Author): 陈远孟;张向军;陈传华;杨新庆;李杨瑞;李容柏;
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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2006.22.016
参考文献(References):
- [1]徐九文,宋爱青,崔明华,等.富硒高产特种稻新品系白香粳[J].中国种业,2001,5:33.
- [2]AGGARWAL K,SHENOY V,RAMADEVI J,et al.Molecular characterization ofsome Indian Basmati and other elite rice genotypes using fluorescent-AFLP[J].Theor Appl Genet,2002,105(5):680-690.
- [3]GARRIS A,MC COUCH S,KRESOVICH S,et al.Population structure and itseffect on haplotype diversity and linkage disequilibrium surrounding thexa5 locusof rice(Oryza sativaL.)[J].Genetics,2003,165:759-769.
- [4]NAGARAJU J,KATHIRVEL M,KUMAR R R,et al.Genetic analysis of tradi-tional and evolve Basmati and non-Basmati rice variety by using fluorescencebase ISSR-PCR and SSR markers[J].Proc Natt Acad Sci,2002,99(9):5836-5841.
- [5]RODER M S,VICTOR K,KATJA W,et al.A microsatellite map of wheat[J].Genetics,1998,149:2007-2023.
- [6]樊叶杨,庄杰云,吴建利,等.应用微卫星标记鉴别水道粕梗亚种[J].遗传,2000,22(6):392-394.
- [7]李莉,杨剑波,MACKILL D J,等.水稻SSR不同检测和分析方法的比较研究[J].中国水稻科学,2000,14(3):185-188.
- [8]武耀廷,张天真,郭旺珍.陆地棉品种SSR标记的多态性及用于杂交种纯度检测的研究[J].棉花学报,2001,13(3):131-133.
- [9]刘峰,东方阳,邹继军,等.应用微卫星标记进行大豆种质多样性和遗传变异性分析[J].遗传学报,2000,27(7):628-633.
- [10]DELLAPORTA S L,WOOD J,HICKS J B,et al.A plant DNA minipreparation:version II[J].Plant Mol Bio Rep,1983,1(4):19.
- [11]NEI M,LI WH.Mathematical model for studying genetic variation in terms ofrestriction endonucleases[J].Proc Natl Acad Sci USA,1979,76:5269-5273.
- [12]孙传清,王象坤,吉村淳,等.普通野生稻和亚洲栽培稻遗传多样性的研究[J].遗传学报,2002,27(3):227-234.