安徽农业科学

2006, (23) 6145-6147+6150

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日本百脉根■牛儿基■牛儿基氢化酶的电子克隆及进化分析
In Silico Cloning and Evolution Analysis of Geranylgeranyl Hydrogenase Gene from Lotus corniculatus var.Japonicus

李晓晓;李蕊;李雅轩;蔡民华;胡英考;

摘要(Abstract):

根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学的方法,以拟南芥牛儿基牛儿基氢化酶(GGH)基因cDNA序列为信息探针,搜索GenBank中的HTGs数据库,找到一个与之高度匹配的日本百脉根基因组DNA序列LJT46M09,用GENSCAN软件分析该序列得到一个包含2个外显子和1个内含子的基因。以此基因序列BLAST检索GenBank中的est-others数据库获得了同源的EST片段。进行EST拼接后得到该基因的cDNA序列,GenBank登录号为DQ013361,由1 389 bp核苷酸组成,具有完整的开放阅读框架(ORF),推测编码蛋白为462个氨基酸。推导的氨基酸序列与大豆、截形苜蓿、烟草、拟南芥、小麦、水稻的牛儿基牛儿基氢化酶基因氨基酸序列的一致率分别为91%、89%、84%、81%7、3%、74%。该基因与叶绿素等的生物合成有关。

关键词(KeyWords): 日本百脉根;■牛儿基■牛儿基氢化酶(GGH);电子克隆;EST

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 北京市教委科技发展计划项目基金(200310028112)资助

作者(Author): 李晓晓;李蕊;李雅轩;蔡民华;胡英考;

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