安徽农业科学

2013, v.41;No.431(34) 13311-13315

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蓖麻WRKY39基因的鉴别与表达特性分析
In Silico Identification and Expression Analysis of WRKY39 Gene from Castor Bean( Ricinus communis L.)

邹智;

摘要(Abstract):

研究基于已公布的EST数据,采用电子克隆的方法获得了蓖麻WRKY39的基因序列。序列分析表明,该基因包含2个内含子,在释放的基因组中因一碱基G的缺失而被错误注释成2个基因;基因预测编码356个氨基酸,理论分子量为38.95 kD,等电点为9.43;蛋白含有一个保守的WRKY结构域,其基序为WRKYGQK_X13_C_X5_C_X23_H_X1_H,归属于II类d亚类,其保守内含子位于304位的R和305位的G之间;基因的启动子区含有多种激素和胁迫应答相关元件,显示出复杂的转录调控网络及在胁迫应答中的重要功能。基因表达谱分析显示,RcWRKY39在叶片、花、胚乳和种子中都有表达,其中在种子中的表达丰度最高,在叶片和花中次之,在胚乳中最低。

关键词(KeyWords): 蓖麻;WRKY转录因子;电子克隆;生物信息学分析

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学资金(31371556);; 海南省自然科学基金(312026);; 中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项(1630022011014)资助

作者(Author): 邹智;

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DOI:

参考文献(References):

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