安徽农业科学

2008, No.220(03) 914-916

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磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of Phosphoenolpyruvate Carboxylase

蔡小宁;陈茜;杨平;任源浩;

摘要(Abstract):

[目的]为改造磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)基因、提高PEPC活性寻找线索。[方法]对GenBank上登录的PEPC的cDNA序列、氨基酸序列进行BLAST搜索,运用生物信息学方法进行信号肽分析、亚细胞定位、结构域分析以及PEPC蛋白质氨基酸序列的同源性分析和系统进化树分析。[结果]共搜寻到62个PEPC蛋白质序列,绝大多数属于C3植物,9个属于C4植物。绝大多数PEPC没有存在信号肽的可能性。62个PEPC蛋白的亚细胞定位基本一致,均具有Phosphoenolpyruvate carboxylase结构域,未发现其他结构域。通过进化树分析可分别将C3植物和C4植物的PEPC酶分成4组和3组。62个PEPC蛋白质氨基酸序列的同源性为86.70%,而其在19个C3植物和9个C4植物中则分别为89.63%和89.61%。[结论]C4植物PEPC的423位上的丙氨酸和862位上的酪氨酸高度保守,而C3植物的428位和871位的氨基酸则缺少同源性,可能与C3和C4植物PEPC的活性差异有关。

关键词(KeyWords): 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC);生物信息学

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 南京晓庄学院生态学重点学科建设项目(2005-2008)

作者(Author): 蔡小宁;陈茜;杨平;任源浩;

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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2008.03.012

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