我国部分区域链格孢属rDNAITS区序列分析Sequence Analysis of ITS Region of rDNA of Alternaria Nees from Some Areas of China
何劲;康冀川;谢红艳;雷帮星;文庭池;
摘要(Abstract)：
[目的]对我国部分区域链格孢属rDNA ITS序列进行分析,从而在分子水平上对其进行鉴定。[方法]使用通用引物ITS4和ITS5对分离自我国部分区域不同寄主链格孢属(AlternariaNees)34个菌株进行ITS基因(ITS1-5.8S-ITS2)的PCR扩增和测序。[结果]序列分析结果表明:5.8S rDNA全长为159 bp,保守程度高,参试的34株菌均一致;ITS区变化相对较大。与A.tenuissima或A.alternata100%同源的分离菌株均表现出对地域和基质的广适性;菌株在5.8S/ITS存在的差异,说明寄主本犀科的丁香叶、蔷薇科、茄科等部分植物的链格孢具有一定的多样性。但同时也发现ITS序列标记在链格孢属部分种间应用有一定的局限性;基于序列ITS1-5.8S-ITS2聚类关系与其地理来源和寄主相关性不大。[结论]ITS序列分析法可为链格孢属的分子鉴定提供理论依据。
关键词(KeyWords)： 链格孢;序列分析;ITS;5.8SrDNA
基金项目(Foundation): 国家自然科学基金(30460003)
作者(Author): 何劲;康冀川;谢红艳;雷帮星;文庭池;
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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2009.06.047
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