我国部分区域链格孢属rDNAITS区序列分析Sequence Analysis of ITS Region of rDNA of Alternaria Nees from Some Areas of China
何劲;康冀川;谢红艳;雷帮星;文庭池;
摘要(Abstract):
[目的]对我国部分区域链格孢属rDNA ITS序列进行分析,从而在分子水平上对其进行鉴定。[方法]使用通用引物ITS4和ITS5对分离自我国部分区域不同寄主链格孢属(AlternariaNees)34个菌株进行ITS基因(ITS1-5.8S-ITS2)的PCR扩增和测序。[结果]序列分析结果表明:5.8S rDNA全长为159 bp,保守程度高,参试的34株菌均一致;ITS区变化相对较大。与A.tenuissima或A.alternata100%同源的分离菌株均表现出对地域和基质的广适性;菌株在5.8S/ITS存在的差异,说明寄主本犀科的丁香叶、蔷薇科、茄科等部分植物的链格孢具有一定的多样性。但同时也发现ITS序列标记在链格孢属部分种间应用有一定的局限性;基于序列ITS1-5.8S-ITS2聚类关系与其地理来源和寄主相关性不大。[结论]ITS序列分析法可为链格孢属的分子鉴定提供理论依据。
关键词(KeyWords): 链格孢;序列分析;ITS;5.8SrDNA
基金项目(Foundation): 国家自然科学基金(30460003)
作者(Author): 何劲;康冀川;谢红艳;雷帮星;文庭池;
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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2009.06.047
参考文献(References):
- [1]崔迪,王继华,陈捷,等.链格孢属真菌对农作物的危害[J]哈尔滨师范大学自然科学学报,2005,21(3):87-91.
- [2]张天宇.中国真菌志,第十六卷:链格孢属[M].北京:科学出版社,2000.
- [3]张天宇,郭英兰.中国链格孢属的研究[J].菌物系统1998,17(1):11-14
- [4]DONGZ,LIUG,QINAY,et.al.Induction of mutagenesis and transforma-tion by the extract of Alternaria alternata isolated tromgrains in Lin xian,China[J].Carcinogenesis,1987,8:989-991.
- [5]YUX,LI J,ZHANGWY.Storage and transport technology of hami melonat ambient temperature[J].Transactions of the CSAE,2002,18(5):187-192.
- [6]郭波,李海燕,张玲琪.一种产长春碱真菌的分离[J].云南大学学报:自然科学版,1998,20(3):214-215.
- [7]葛菁萍,平文祥,马玺,等.紫杉醇产生菌HU1353的鉴定[J].微生物学杂志,2004,24(3):19-21.
- [8]沈瑞清,张天宇.培养基对链格孢属(AlternariaNees)真菌种级形态分类特征影响的研究[J].宁夏农学院学报,2003,24(3):1-5.
- [9]匡治州,许杨.核糖体rDNAITS序列在真菌学研究中的应用[J].生命的化学,2004,24(2):120-122.
- [10]ANDERSEN B,THRANE U.Differentiation ofAlternariainfectoria andAlternariaalternata based on morphology,metabolite profiles,and culturalcharacteristics.[J].Microbiol,1996,42:685-689.
- [11]BROWER A V,DESALLE R,VOGLER A.Gene tree,species trees,andsystemtics:ACladistic Perspective[J].Ann Rev Ecol Syst,1996,27:423-450.
- [12]KANGJ C,KONGR Y C,HYDE KD.Phylogeny of Amphisphaeriaceae(sensu stricto)and related taxa revisited based on nrDNAsequences[J].Mycotaxon,2002,81:321-330.
- [13]于金凤,伍恩宇,夏海波.核糖体RNA基因在丝核菌分子系统学研究中的应用[J].菏泽学院学报,2006,28(5):103-107.
- [14]YINGML,CHENGMT.MakotoKakishima phylogenetic relationshipson14 morphologically similar species of Pucciniastrum in Japan based onrDNAsequence data[J].Mycoscience,2006,47:137?144.
- [15]林加涵,魏文铃,彭宣宪.现代生物学实验(下册)[M].北京:高等教育出版社,2001:98-103.