安徽农业科学

2017, v.45;No.549(08) 159-160

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动物双歧杆菌AD011细胞壁蛋白的预测和功能分析
Prediction and Functional Analysis of Cell Wall Proteins of Bifidobacterium animalis AD011

朱德全;王茗悦;姚嘉;张跃华;韩诚武;卢伟;栾积毅;刘向东;

摘要(Abstract):

[目的]运用生物信息学方法预测动物双歧杆菌AD011锚定于细胞壁的蛋白并进行功能分析,为后续研究该菌与宿主相互作用的分子机制提供基础资料。[方法]用Phobius和SignalP 4.0软件对动物双歧杆菌AD011全基因组编码蛋白中细胞壁蛋白进行预测,同时采用COG(Cluster of Orthologous Groups of proteins)功能数据库对预测的细胞壁蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]动物双歧杆菌AD011基因组1 518个编码蛋白中,11个蛋白含有细胞壁的锚定基序,6个蛋白含有LP×TG基序,1个蛋白含有Lys M基序,1个蛋白含有PG结合区域,2个蛋白含有SLH结构域,1个蛋白含有NLPC_P60结构域。细胞壁蛋白功能分析结果显示,11个细胞壁蛋白中,9个蛋白没有功能注释,2个蛋白(NLP/P60 protein和1,4-beta-N-acetylmuramidase)参与细胞壁和细胞膜的生物合成。[结论]动物双歧杆菌AD011大多数细胞壁蛋白功能未知,还需在以后的研究中进行进一步的功能注释。

关键词(KeyWords): 两歧双歧杆菌;基因组;细胞壁蛋白;功能

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 黑龙江省卫生计生委科研项目(2016-325);; 佳木斯大学科技创新团队项目(cxtd-2016-02)

作者(Author): 朱德全;王茗悦;姚嘉;张跃华;韩诚武;卢伟;栾积毅;刘向东;

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