安徽农业科学

2008, (11) 4753-4755

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油桐种子FADX基因的克隆和序列分析
Study on the Cloning and Sequence Analysis of FADX Gene from Vernicia fordii

李元;汪阳东;李鹏;魏建民;

摘要(Abstract):

[目的]克隆油桐种子FADX基因全长cDNA。对该基因作生物信息学分析,为进一步研究该基因的功能提供参考。[方法]以未成熟的油桐种子为材料,利用改良TRIzoL法提取总RNA,并根据GenBank中已经登录的α桐酸合成酶基因FADX的序列,设计特异性引物;采用RTPCR方法,克隆得到FADX基因全长cDNA,应用Antheprot软件和InterProScan对该基因进行了生物信息学分析。[结果]该序列5'端和3'端非编码区序列长度分别为13、47 bp,含有1个开放阅读框(14~1 174 bp),编码386个氨基酸,含有典型的脂肪酸脱氢酶结构域;相对分子量是44 343.0,理论等电点为8.33。二级结构预测表明,该蛋白α螺旋含量占29%,β折叠占32%,转角占6%。[结论]该蛋白属于脂肪酸脱氢酶。

关键词(KeyWords): 油桐;FADX基因;克隆;生物信息学分析

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 浙江省重大科技项目“能源植物种质资源与高能植物品种选育及中试”(2006#2009)(2005C12003);; 中国林科院科技发展基金项目“生物柴油原料植物油桐脂肪酸合成酶相关基因克隆和功能分析”(2006-2007)

作者(Author): 李元;汪阳东;李鹏;魏建民;

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