安徽农业科学

2007, (09) 2566-2568+2658

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西瓜炭疽菌核糖体基因ITS区段的克隆及序列分析
Cloning and Sequencing of Ribosomal RNA Gene ITS in Colletotrichum orbiculare

唐建辉;王伟;

摘要(Abstract):

采用真菌核糖体基因转录间隔区域(ITS)通用引物,PCR扩增4个来自不同地方的西瓜炭疽病菌核糖体基因的ITS1和ITS2,并对PCR产物进行了克隆和序列分析。结果表明:西瓜炭疽病菌的ITS全长481 bp,其中ITS1长163 bp,5.8 S长153 bp,ITS2长165 bp,各碱基A、T、G、C的个数分别为1101、061、181、47,GC含量为55.1%。用Mega3软件对此4个序列以及GeneBank中登录的炭疽属其他24个种的ITS1和ITS2聚类分析,结果显示:Colletotrichum属可以分为13个聚类组,各聚类组间存在着一定的遗传多样性,其中Colletotrichum orbicu-lare、Colletotrichum lindemuthiana在ITS1I、TS2上都聚为一组,这就为用ITS作为靶序列来设计特异性引物将Colletotrichum orbiculare、Colletotrichum lindemuthiana与其他种分开提供了分子依据。

关键词(KeyWords): Colletotrichumorbiculare;核糖体基因转录间隔区;聚类组

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 上海市重大科技攻关项目(03DZ19316);; 上海市科技兴农重点攻关项目[农科攻字2002(第3-1-2号)]

作者(Author): 唐建辉;王伟;

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