泰山螭霖鱼线粒体COⅠ基因序列的遗传多样性分析Study on Genetic Diversity of Varicorhinus macrolepis Based on COⅠ Gene Sequences
杨玲;巩俊霞;付佩胜;李娴;张金路;
摘要(Abstract):
[目的]通过克隆泰山螭霖鱼的COⅠ基因序列,研究其与鲤科几属鱼类的进化关系,确定泰山螭霖鱼的分类地位。[方法]以泰山螭霖鱼30个个体为材料,对其线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)的部分序列进行PCR扩增和序列对比,检测泰山螭霖鱼的遗传多样性;计算泰山螭霖鱼不同单倍型与Gen Bank中鲤科5个属鱼类的遗传距离,采用聚类分析方法,构建NJ和UPGMA系统进化树。[结果]30个个体泰山螭霖鱼线粒体COⅠ基因片段长度约1 600 bp,无碱基的插入和缺失,纯化并去除引物序列后获得约1 493 bp的核苷酸序列,存在6种单倍型,共检测到6个多态位点,包括4个转化、2个颠换,其单倍型多样性(Hd)为0.460,核苷酸多样性(Pi)为0.000 78,平均核苷酸差异数(K)1.163。遗传距离和NJ和UPGMA系统进化树表明,泰山螭霖鱼与多鳞白甲鱼的COⅠ序列一致,泰山螭霖鱼所在的突吻鱼属与光唇鱼属的亲缘关系最近,与金线鲃属、倒刺鲃属、华鲮属的亲缘关系较远。[结论]该研究为其种质资源的管理与保护及遗传育种提供分子生物学依据。
关键词(KeyWords): 泰山螭霖鱼;COⅠ;遗传多样性
基金项目(Foundation): 山东省农业良种工程项目“水产经济生物种质资源收集保护与评价”子课题三“淡水水产经济生物种质资源收集、保护与评价”;; 山东省现代农业产业体系鱼类创新团队项目(SDAIT-12-04)
作者(Author): 杨玲;巩俊霞;付佩胜;李娴;张金路;
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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2016.27.044
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