安徽农业科学

2018, v.46;No.578(01) 96-101

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2种果蝇(Drosophila melanogaster与D.sechellia)线粒体及NADH dehydrogenase subunit基因的密码子偏好性分析
Comprehensive Analysis of Codon Usage Bias of Drosophila melanogaster and D. sechellia mitochondrion and NADH dehydrogenase subunit Gene Family

王鹏飞;高欢欢;苏玲;蒋锡龙;吴新颖;杨立英;任凤山;王咏梅;

摘要(Abstract):

[目的]分析2种果蝇(Drosophila melanogaster与D.sechellia)线粒体基因组及NADH dehydrogenase subunit基因的密码子偏好性。[方法]利用Codon W1.4计算密码子偏好性参数的相关参数。[结果]2种果蝇线粒体中蛋白编码基因的AT含量比GC含量更高。D.sechellia的线粒体基因组的密码子偏好性比黑腹果蝇D.melanogastera的线粒体基因组的密码子偏好性略强。2种果蝇线粒体基因组中各蛋白编码基因CDs中,RSCU值大于1的密码子都是以A或U结尾,而并不以C或G结尾。2种果蝇线粒体基因组及NADH dehydrogenase subunit基因簇基因的密码子偏好性都可能受到突变压力影响。D.melanogaster线粒体基因组中不存在密码子CGC。NADH dehydrogenase subunit 3基因的密码子偏好性可能比其他NADH dehydrogenase subunit基因更高。此外,尽管大部分NADH dehydrogenase subunit基因偏爱使用A或U结尾的密码子,但是在NADH dehydrogenase subunit 6基因中,有2个AU结尾的密码子(AGA、GCA)的RSCU也为0。[结论]该研究结果为2种果蝇线粒体的进化研究提供了新观点。

关键词(KeyWords): 果蝇;葡萄;线粒体;密码子偏好性;NADH dehydrogenase subunit;RSCU

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 山东省农业重大应用技术创新项目“特色酒用葡萄产期精准调控与产品创新研究应用”;山东省农业重大应用技术创新项目“山东葡萄酒地标性酒种开发与关键技术集成应用”;; 山东省农业科学院农业科技创新工程项目(CXGC2016D01)

作者(Author): 王鹏飞;高欢欢;苏玲;蒋锡龙;吴新颖;杨立英;任凤山;王咏梅;

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DOI:

参考文献(References):

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