安徽农业科学

2008, (22) 9536-9539

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猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株非编码区及结构蛋白的生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of Untranslated Region and Structural Protein of SC-Y Strain of Transmissible Gastroenteritis Virus

宋振辉;张鹦俊;

摘要(Abstract):

利用生物软件对猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株非编码区及结构蛋白所含的生物学信息进行了分析。结果显示,SC-Y株与TGEV其他参考毒株(Miller M60、Miller M6、Purdue、Purdue P115、PUR46-MAD、TS)5′UTR的二级结构差异显著,预测结构蛋白特性显示,N蛋白没有跨膜区域、糖基化位点及信号肽序列,属于非分泌性蛋白。在4种结构蛋白中,N蛋白的氨基酸变异率最低,为2.14‰。与MillerM60株、Miller M6株和TS株相比,SC-Y株S基因第1 123~1 128位核苷酸缺失6个碱基(AATGAT),在sM基因核苷酸第163~165位,SC-Y株比TFI株和FS772/70株多出3个碱基(ATT)。

关键词(KeyWords): 猪传染性胃肠炎病毒;SC-Y;非编码区;结构蛋白;生物信息学分析

Abstract:

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基金项目(Foundation):

作者(Author): 宋振辉;张鹦俊;

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