安徽农业科学

2019, v.47;No.632(19) 175-177

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双歧杆菌BB12菌株Sec分泌途径及底物蛋白分析
Analysis of Sec Secretion Pathway and Substrate Protein of Bifidobacterium BB12

岳旭升;暮雪;张百惠;吴天;张路路;朱德全;

摘要(Abstract):

[目的]采用生物信息学方法分析双歧杆菌BB12菌株的Sec途径分泌系统及预测底物蛋白。[方法]以双歧杆菌BB12菌株基因组注释的蛋白氨基酸序列为研究对象,在NCBI中以Fasta形式下载,采用一系列生物信息学软件分析该基因组中Sec分泌途径及底物蛋白行使的功能,同时采用COG功能数据库对这些蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]通过分析发现双歧杆菌BB12菌株Sec分泌途径相关的蛋白基因共有9个,其中5个是Sec分泌途径构建蛋白基因,2个信号肽酶识别基因,1个脂蛋白信号肽识别基因和1个信号肽识别蛋白编码基因。Sec底物蛋白分析发现该菌共含1 583个蛋白,经过Sec分泌途径到细胞外的蛋白有57个,35个具有COG功能,占61%,其中被Spase Ⅰ型信号肽酶识别的有37个,被SpaseⅡ型信号肽酶识别的有20个。[结论]COG功能注释显示一些蛋白没有功能,有功能的蛋白主要与氨基酸运输和代谢、碳水化合物的运输和代谢、功能细胞壁/膜和无机离子运输和代谢功能有关。

关键词(KeyWords): 双歧杆菌BB12;基因组;分泌蛋白;功能分析

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 黑龙江省大学生创新创业训练计划重点项目(201810222022)

作者(Author): 岳旭升;暮雪;张百惠;吴天;张路路;朱德全;

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