安徽农业科学

2018, v.46;No.610(33) 75-79+103

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2016—2017年我国部分地区白斑综合征病毒wsv006的变异分析
Variation Analysis of wsv006 in WSSV Epidemic Strains from Partial Areas of China during 2016-2017

蔡苗;刘庆慧;万晓媛;黄倢;

摘要(Abstract):

[目的]了解wsv006蛋白结构变异情况,并进一步为其蛋白功能研究提供参考资料。[方法]以2016和2017年在全国18个地区采集的WSSV阳性样品为模板,采用PCR方法,用特异性引物扩增wsv006基因,经连接转化后进行测序,并对测序结果进行分析。[结果]在2016年的47份样本中有9个样本,包括河北黄骅、山东日照、河北沧州和河北唐山4个地区的样本中出现了wsv006目的条带,检出率为19%。在2017年的39份WSSV阳性样本中有16个样本,包括福建霞美镇、河北黄骅、广东湛江、山东滨州、山东东营和上海6个地区的样本中出现了wsv006的目的条带,检出率为41%。氨基酸序列比对结果显示,扩增的wsv006编码氨基酸变异包括氨基酸替换、插入、缺失和提前终止翻译,其中插入的主要是脯氨酸(P)和苏氨酸(T),插入位点在第151~166位,处于PT的交叉重复区域;终止翻译是由于核苷酸第541位插入了GAGG,在转录过程中形成了终止密码子。[结论]wsv006氨基酸序列存在明显变异。

关键词(KeyWords): WSSV;wsv006;变异

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金项目(31672679);; 国家重点基础研究发展计划项目(2012CB114401);; 现代农业产业技术体系项目(CARS-47)

作者(Author): 蔡苗;刘庆慧;万晓媛;黄倢;

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参考文献(References):

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