安徽农业科学

2010, v.38;No.312(23) 12471-12475

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牛SLC27A1基因SNPs筛选及其与中国荷斯坦奶牛产奶性状的关联分析
Identification of SNPs in Bovine SLC27A1 Gene and Its Effects on Milk Production Traits in Chinese Holstein Cattle

吕延飞;魏彩虹;张莉;路国彬;刘开东;陆健;孙丹;张世芳;柳楠;杜立新;

摘要(Abstract):

[目的]对牛SLC27A1基因进行SNPs筛选并与中国荷斯坦奶牛的产奶性状进行关联分析,以期发现对中国荷斯坦奶牛产奶性状有显著影响的SNP位点。[方法]根据性能测定记录选取48头中国荷斯坦奶牛,提取血样DNA,组成2个DNA池,用于SNPs筛选,采用PCR-SSCP和克隆测序方法对DNA池进行SLC27A1基因SNPs筛选。针对发现的SNP位点,采用PCR-RFLP方法对另外231头中国荷斯坦奶牛进行群体基因型检测,采用SAS(8.02)GLM过程对各基因型与产奶性状进行关联分析。[结果]在exon3发现T112C位点,在3‘UTR发现G64A位点,T112C为同义突变;经PCR-RFLP检测,发现在T112C位点存在TT、TC、CC3种基因型,G64A位点存在GG、GA、AA3种基因型。2个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。T112C位点的CC型个体的产奶量极显著高于TC型个体(P<0.01),3种基因型对乳蛋白率和乳脂率影响均不显著(P>0.05),乳蛋白率呈现CC>TC>TT的趋势,乳脂率呈现TT>TC>CC的趋势;G64A位点3种基因型对产奶量、乳蛋白率、乳脂率的影响均不显著(P>0.05),但产奶量呈现GA>GG>AA的趋势,乳蛋白率和乳脂率呈现AA>GG>GA的趋势。[结论]该基因T112C位点与产奶量性状有一定的关联性,通过提高CC基因型频率有望提高中国荷斯坦奶牛的产奶量,SLC27A1基因可作为调控中国荷斯坦奶牛产奶量的候选基因,同时为该基因的标记辅助育种和进一步研究奠定了良好基础。

关键词(KeyWords): SLC27A1基因;SNPs;PCR-SSCP;PCR-RFLP;产奶性状

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家科技支撑计划课题(2006BAD04A01);; 国家自然科学基金(30571329)

作者(Author): 吕延飞;魏彩虹;张莉;路国彬;刘开东;陆健;孙丹;张世芳;柳楠;杜立新;

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DOI:

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