安徽农业科学

2012, v.40;No.367(06) 3243-3244+3250

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应用生物信息学分析大米过敏原RAG1的B细胞表位
Bioinformatics Analysis on B Cell Epitopes of Rice Allergen RAG1

李燕芳;何颖;邹泽红;

摘要(Abstract):

[目的]预测大米主要过敏原RAG1的二级结构及B细胞表位。[方法]从Expasy蛋白质数据库中获得编码大米过敏原RAG1的氨基酸序列并以此氨基酸序列为基础,通过DNAStar Protean软件,采用Gamier-Robson方案、Chou-Fasman方案和Karplus-Schulz方案预测RAG1的二级结构,用Kyte-Doolittle亲水性方案、Emini表面可及性方案J、ameson-Wolf抗原性指数方案综合预测RAG1的B细胞表位。[结果]对大米过敏原RAG1的二级结构和B细胞表位预测的结果表明,第33~441、19~129、155~163区段可能是B细胞的优势表位。[结论]该研究综合应用多方法多参数预测大米过敏原RAG1潜在的B细胞优势表位,为RAG1 B细胞表位的进一步鉴定及其抗原性改造、表位疫苗设计等研究提供了理论依据。

关键词(KeyWords): 大米过敏原;RAG1;二级结构;B细胞表位

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金项目(30771240);; 广州市教育系统科研创新学术团队(B94118)课题

作者(Author): 李燕芳;何颖;邹泽红;

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