安徽农业科学

2012, v.40;No.364(03) 1336-1339

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东乡野生稻渐渗系基因组结构变化及多样性分析
Analysis on Genomic Structure Changes and Diversity of Introgression Lines in Dongxiang Wild Rice (O.rufipogon Griff.)

邓晓娟;罗向东;谢建坤;万勇;胡标林;曹娟芳;戴亮芳;

摘要(Abstract):

[目的]研究东乡野生稻渐渗系基因组结构变化及对其进行多样性分析。[方法]以东乡野生稻(O.rufipogon Griff.,供体)和栽培稻协青早B(O.sativa sp.indica Kato.,受体)构建的BC1F6渐渗群体为研究材料,利用筛选出的分布在12对染色体上的25对SSR引物对群体中的239个株系进行多态性分析。[结果]25个微卫星位点都有东乡野生稻DNA片段不同程度的渗入,群体均大部分保留亲本协青早B或东乡野生稻的DNA序列。渐渗系基因组中平均受体纯合条带百分率为78.13%,最高达94.98%(引物为RM131),最低为60.25%(引物为RM171)。平均供体纯合条带百分率为13.37%,最高达32.64%(引物为RM171),最低为2.93%(RM1095)。群体中还存在一些杂合位点,平均杂合率为5.62%,最高达10.04%(引物为RM401)。此外,BC1F6渐渗群体中发现有双亲条带的丢失和一些双亲所没有的新条带出现,其中平均亲本条带丢失率为2.88%,最高达13.39%(引物为RM311),最低为0(引物为RM401),平均新带率为1%。高世代渐渗群体平均Nei’s基因多样性(He)和平均Shannon’s信息多样性指数(I)分别为0.276和0.457。[结论]通过远缘杂交,渐渗系发生了广泛遗传与表观遗传变异,扩大了遗传变异基础,为水稻品种改良与种质创新奠定了重要基础。

关键词(KeyWords): 东乡野生稻;渐渗系;SSR分析;基因组结构变化;遗传变异

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然基金项目(30860120、30900781);; 江西省教育厅科技计划项目(GJJ09464);; 江西省自然基金(2008GQN0059)

作者(Author): 邓晓娟;罗向东;谢建坤;万勇;胡标林;曹娟芳;戴亮芳;

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