安徽农业科学

2018, v.46;No.588(11) 78-80

[打印本页] [关闭]
本期目录(Current Issue) | 过刊浏览(Past Issue) | 高级检索(Advanced Search)

生物土壤结皮土生对齿藓转录组SSR位点分析
Analysis in SSR Information in Biological Soil Crusts Didymodon vinealis Transcriptome

陈莉;赵浩然;黄琳淞;玉苏甫江;

摘要(Abstract):

[目的]分析生物土壤结皮土生对齿藓转录组SSR位点。[方法]以生物土壤结皮土生对齿藓为材料,分析土生对齿藓转录组数据,开发土生对齿藓SSR分子标记技术。[结果]通过MISA软件对土生对齿藓高通量测序获得的73 084条unigenes进行SSR筛选。从搜索序列中发现4 103个符合条件的SSRs,分布在3 420条unigenes上,出现频率为5.62%。三核苷酸和二核苷酸为主要重复类型,分别占SSR总数的47.9%和26.1%,AGC/CTG(31.9%)和AG/CT(75.5%)分别是其主要重复基元。69.0%的基序长度为12~20 bp。[结论]土生对齿藓转录组SSR位点出现频率高、类型丰富、多态性潜能大,为土生对齿藓分子生物学机制研究等方面提供理论依据。

关键词(KeyWords): 土生对齿藓;转录组;SSR

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金项目(31560120);; 西北民族大学中央高校基本科研业务费项目(Y17015)

作者(Author): 陈莉;赵浩然;黄琳淞;玉苏甫江;

Email:

参考文献(References):

扩展功能
本文信息
服务与反馈
本文关键词相关文章
本文作者相关文章
中国知网
分享