安徽农业科学

2014, v.42;No.467(34) 12132-12136

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杂种杨树木葡聚糖内糖基转移酶基因(XET)的生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of Populus alba × Populus tremula var. glandulosa Xyloglucan Endotransglycosylase(XET) Gene

赵慧;王遂;刘笑平;林永红;王松波;宋双林;李开隆;

摘要(Abstract):

[目的]通过生物信息学方法对杂种杨树木葡聚糖内糖基转移酶基因的DNA序列、蛋白质序列进行分析预测,为进一步研究奠定基础。[方法]以XET基因及其氨基酸序列为研究对象,利用多种网络数据库及生物信息学软件对其进行分析预测。[结果]该基因编码290个氨基酸残基,相对分子质量33 672.0 D,理论等电点(p I)7.04;该酶可能存在3个卷曲结构部位、1个信号肽剪切位点和1个跨膜区,是典型的分泌蛋白;三级结构同源建模预测结果较好,二级结构预测中的螺旋、卷曲和折叠均可见。相似性比对和进化分析显示其与葡萄等的序列相似度较高;而蛋白质三级结构的预测则发现,该酶与几种杆菌的蛋白较接近。[结论]XET基因可能在很多生物中具有较高的保守性。

关键词(KeyWords): 杨树;木葡聚糖内糖基转移酶;生物信息学

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): “863”项目(2013AA102701)

作者(Author): 赵慧;王遂;刘笑平;林永红;王松波;宋双林;李开隆;

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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2014.34.048

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