安徽农业科学

2011, v.39;No.347(22) 13298-13300+13308

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不同物种Mitf基因编码区生物信息学分析
Bioinformatics Analysis on the Coding Region of Mitf Gene among Different Species

张丽英;李祥龙;周荣艳;李兰会;杨清芳;

摘要(Abstract):

[目的]对不同物种Mitf基因编码区(CDS)进行生物信息学分析。[方法]采用生物信息学方法分析了小家鼠、褐家鼠、人、黑猩猩、狨、毛猩猩、猕猴、家马、大熊猫、野猪、原鸡和非洲爪蟾Mitf基因编码区的遗传多样性,并对Mitf氨基酸序列、组成成分、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构和结构域进行预测和推断。[结果]在12个物种的37条Mitf基因CDS序列中,共检测到466个多态位点,生成16种单倍型,Mitf基因序列编码区在种内及种间存在丰富的遗传多样性;Mitf蛋白理论等电点均低于7,呈酸性,N端无信号肽,无跨膜结构域,肽链表现为亲水性;蛋白质二级结构的主要元件为α-螺旋和无规则卷曲,有2个保守结构域。[结论]该研究为探明Mitf基因在不同种间和种内的遗传分化,进而为相关黑色素基因的遗传学和进化分析奠定了基础。

关键词(KeyWords): Mitf基因;编码区;物种;生物信息学

Abstract:

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作者(Author): 张丽英;李祥龙;周荣艳;李兰会;杨清芳;

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参考文献(References):

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