安徽农业科学

2012, v.40;No.368(07) 3884-3888

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动物组蛋白H3K4三甲基化转移酶MLL3的生物信息学分析
Bioinformatics Analysis on Histone H3-lys-4 Methyltransferase MLL3 in Animals

尚明保;杨旬旬;吴风瑞;丁彪;刘勇;李文雍;

摘要(Abstract):

[目的]对动物组蛋白H3K4三甲基化转移酶MLL3进行生物信息学分析。[方法]利用生物信息学的方法,对小鼠MLL3的基因结构、氨基酸序列、系统进化树、染色体定位和共线性等问题进行分析。[结果]编码合成的小鼠MLL3蛋白质一级结构包括7个锌指结构域、1个HMG-box(高迁移率族蛋白)、1个FYRN(N-末端富含苯丙氨酸或酪氨酸区域)、1个FYRC(C-末端富含苯丙氨酸或酪氨酸区域)、1个SET域和1个postSET域;从序列对比和同源性上发现,该研究中的19种动物都基本上具有这些结构,说明这些结构在进化上是相对保守的,其中SET域具有高度的保守性,是维持组蛋白甲基化酶活性所必须的;从系统发生上看,19种动物在进化树上的位置与其分类地位相一致;在共线性分析中,虽然小鼠和人的MLL3基因位于不同的染色体上,但其上游和下游具有相同的基因,说明小鼠和人的MLL3基因具有共线性。[结论]不仅揭示了MLL3的核苷酸序列及其氨基酸序列的一级结构,为以后研究其高级结构和蛋白质的功能奠定了基础;同时也为后期进行小鼠MLL3基因的引物设计、启动子分析、基因的克隆、定位和表达的调控模式研究奠定了基础。

关键词(KeyWords): 组蛋白甲基化酶;MLL3;SET结构域;生物信息学

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金(31071310);; 阜阳师范学院省级科研机构委托专项(2011PTFY03ZD);阜阳师范学院自然科学基金(2010FSKJ13);; 安徽省教育厅高校自然科学研究项目(KJ2011B121)

作者(Author): 尚明保;杨旬旬;吴风瑞;丁彪;刘勇;李文雍;

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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2012.07.006

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