真核生物启动子预测相关数据库资源概述The Databases of Eukaryotic Promoters and Related Software Resources
刘玉瑛;张江丽;
摘要(Abstract)：
启动子是基因表达调控的重要元件,深入研究启动子的结构和功能,是理解基因转录调控机制和表达模式的关键。随着生物技术和计算机技术的高速发展,应用生物信息学技术对启动子进行预测和分析的方法得到了很大发展。对目前常用的真核生物启动子预测相关数据库和软件资源作了简单介绍。
关键词(KeyWords)： 真核生物;启动子;数据库;预测
基金项目(Foundation):
作者(Author): 刘玉瑛;张江丽;
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DOI:
参考文献(References)：
- [1]CHRISTOPHD,VIVIANE P.The Eukaryotic promoter database EPD:the impactof in silico primer extension[J].Nucleic Acids Research,2004,32:82-85.
- [2]KENICHI H,YOSHIHIRO U.Plant cis-acting regulatory DNA elements(PLACE)database:1999[J].Nucleic Acids Research,1999,27(1):297-300.
- [3]KOLCHANOV N A,LGNATIEVA E V.Transcription regulatory regions database(TRRD):its status in 2002[J].Nucleic Acids Research,2002,30(1):312-317.
- [4]MATYS V,FRICKE E.TRANSFAC:transcriptional regulation,from patterns toprofiles[J].Nucleic Acids Research,2003,31(1):374-378.
- [5]TOMPA M,LIN,BAILEY T L,et al.Assessing computational tools for the dis-covery of transcription factor binding sites[J].Nature Biotech,2006,23:137-144.