紫花苜蓿乙酰CoA硫解酶的生物信息学分析与同源建模Bioinformatics Analysis and Homology Modeling of Acetoacetyl-CoA thiolase(mAACT) from Medicago sativa L.
陈建刚;王海波;
摘要(Abstract)：
[目的]对紫花苜蓿中的乙酰CoA硫解酶进行生物信息学分析与同源建模。[方法]应用生物信息学软件预测紫花苜蓿乙酰CoA硫解酶的理化性质、亲/疏水性、卷曲螺旋结构、糖基化位点、活性位点、亚细胞定位、二级结构、结构域及三维高级结构。[结果]该蛋白质是一个极疏水性蛋白,含403个氨基酸,理论等电点为6.95;包含1个明显卷曲螺旋结构、5个糖基化位点、1个硫解酶结构域;二级结构中α-helix(Hh)占39.95%、Extended strand(Ee)占16.38%、Random coil(Cc)占43.67%;Ramachandram结构检测表明预测蛋白质残基的二面角有90%以上位于黄色区域,符合立体化学能量规则。[结论]为该蛋白功能的探索提供了一定的理论参考。
关键词(KeyWords)： 紫花苜蓿;乙酰CoA硫解酶;同源建模
基金项目(Foundation): 曲靖师范学院生物科学重点专业建设项目;; 曲靖师范学院面上研究项目(2010MS007)
作者(Author): 陈建刚;王海波;
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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2012.30.213
参考文献(References)：
- [1]张瑛,罗世武,王秉龙.紫花苜蓿改良盐碱地效果研究[J].武汉农业科技,2009(20):121.
- [2]薛庆中.DNA和蛋白质序列数据分析工具[M].北京:科学出版社,2009:75-77.
- [3]孙涌栋,张传来,罗未蓉,等.黄瓜CsEXP10基因的电子克隆及生物信息学分析[J].生物信息学,2008,6(3):113-116.
- [4]ARNOLD K,BORDOLI L,KOPP J,et al.The SWISS-MODEL Workspace:A web-based environment for protein structure homology modelling[J].Bioinformatics,2006,22:195-201.
- [5]李军,张莉娜,温珍昌.生物软件选择与使用指南[M].北京:化学工业出版社,2008:1-3.