安徽农业科学

2011, v.39;No.353(28) 17168-17171+17175

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隐藏嗜酸菌Acidiphilium cryptum JF-5分泌蛋白质组的分析
Analysis of Signal Peptide of the Secreted Protein in Genome of Acidiphilium Cryptum JF-5

焦春香;张奉波;夏金兰;张成桂;

摘要(Abstract):

[目的]对隐藏嗜酸菌(Acidiphilium cryptumJF-5)全基因组的3063个氨基酸序列进行预测,分析其分泌蛋白质组的构成。[方法]利用信号肽预测软件SignalPv3.0、跨膜螺旋结构预测软件TMHMMv2.0、RR-motif信号肽预测软件TatPv1.0、脂蛋白质信号肽预测软件LipoPv1.0、非经典分泌蛋白质预测软件SecretomeP和亚细胞定位软件Psortbv2.0.4对Acidiphilium cryptumJF-5全基因组的3063个氨基酸序列进行预测分析。[结果]在隐藏嗜酸菌Acidiphilium cryptumJF-5中有444个蛋白质为分泌蛋白质,其中分泌型信号肽148个,RR-motif亚组型信号肽27个,脂蛋白质信号肽22个,无Prepiplin-like信号肽,非经典分泌蛋白质247个;另外,对分泌型信号肽的长度分布、氨基酸使用频率和酶切位点的氨基酸使用频率作出了统计分析。[结论]研究结果为进一步研究嗜酸菌Acidiphilium cryptumJF-5的基因功能提供了丰富的信息基础。

关键词(KeyWords): 隐藏嗜酸菌Acidiphilium cryptumJF-5;分泌蛋白质组;信号肽

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金项目(50974140)

作者(Author): 焦春香;张奉波;夏金兰;张成桂;

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