安徽农业科学

2014, v.42;No.464(31) 10867-10872

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毛白杨(BJHR01)磷酸肌醇特异性磷脂酶C(PLC2)基因生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of Populus tomentosa cultivar BJHR01 Phosphoinositide-specific phospholipase C(PLC2) Gene

李墨野;赵慧;姜洋;刘笑平;林永红;李开隆;

摘要(Abstract):

[目的]用生物信息学手段分析、预测毛白杨PLC2基因/蛋白质的结构与特征,为该基因的克隆及功能研究提供理论参考。[方法]以PLC2基因及对应蛋白质为研究对象,利用各种网上数据库及生物信息学分析软件对其进行相关分析、预测。[结果]PLC2基因的GenBank登录号为JX424764.1,ORF长957bp,编码318个氨基酸,对应蛋白质PLC2的分子量35 999.1D,理论等电点7.07;PLC2与毛果杨(XP_002313726.1)的同源性较高;PLC2属于PI-PLCc_GDPD_SF超家族,无O-糖基化位点,无二硫键,无跨膜区和信号肽,有16个磷酸化位点。[结论]对PLC2基因/蛋白的各级结构及功能进行预测,为下一步试验奠定基础。

关键词(KeyWords): 毛白杨;磷酸肌醇特异性磷脂酶C;生物信息学

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 863课题“林木抗逆关键基因的鉴定及分子育种技术研究”(2013AA102701)

作者(Author): 李墨野;赵慧;姜洋;刘笑平;林永红;李开隆;

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DOI: 10.13989/j.cnki.0517-6611.2014.31.015

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