利用荧光多重PCR技术分析8个兔品种遗传多样性Genetic Diversity of Eight Rabbit Breeds Based on Fluorescent Multiplex PCR Technique
张蕾;石福岳;秦立志;潘雨来;吴信生;
摘要(Abstract)：
[目的]揭示8个兔品种的遗传多样性。[方法]采用荧光-多重PCR技术,筛选出多态性较好的18对微卫星引物,对苏系长毛兔、皖系长毛兔、美系獭兔、新西兰白兔、福建黄兔、闽西南黑兔、九疑山兔和比利时兔进行遗传多样性检测。[结果]8个兔品种在18个微卫星座位上的基因频率存在一定的差异;8个兔品种的平均多态信息含量为0.418 5～0.548 9。福建黄兔的平均多态信息含量最高,为0.548 9;苏系长毛兔的平均多态信息含量最低,为0.418 5。平均遗传杂合度也出现了类似的结果,说明福建黄兔的遗传多样性最丰富。根据各品种之间的遗传距离,将8个兔品种分为3大类:苏系长毛兔、皖系长毛兔、美系獭兔、九疑山兔和闽西南黑兔聚为第1类群,新西兰白兔和福建黄兔聚为第2类群,比利时兔为第3类群。[结论]该研究可为家兔种质资源的有效保护和合理利用提供理论依据。
关键词(KeyWords)： 家兔;微卫星标记;遗传多样性;聚类分析
基金项目(Foundation): 现代农业产技术体系建设专项(CARS-44-A-1);; 江苏省高新技术项目(BG2007325)
作者(Author): 张蕾;石福岳;秦立志;潘雨来;吴信生;
Email:
DOI:
参考文献(References)：
- [1]BARKER J S F,MOORE S S,HETZEL D J S,et al.Genetic diversity of A-sian water buffalo(Bubalus bubalis)microsatellite variation and a compari-son with protein coding loci[J].Animal Genetics,1997,28:103-115.
- [2]CAON J,ALEXANDRINO P,BESSA I,et al.Genetic diversity of local Eu-ropean beef cattle breeds for conservation purposes[J].Genet Sei Evol,2001,33:311-332.
- [3]JOONGHO SHIN,AZADEH AZARBAYEJANI,ZIQIAN YUAN,et al.Anovel deletion A mutation within the 3'untranslated region of the EGFRgene contributes to EGFR overexpression inmicrosatellite unstable(MSI)colon cancer(CRC)that results from increased mRNA stability[J].Journalof the American College of Surgeons,2008,207(3):102-103.
- [4]李慧芳,陈维宽,杨宁,等.中国地方家鸭品种的分子遗传多样性研究[J].畜牧兽医学报,2006,37(11):25-32.
- [5]黄生强,柳小春,晏光荣,等.微卫星标记预测猪部分经济性状杂种优势的研究[J].湖南农业大学学报,2007,33(5):592-594.
- [6]JOSEPH S,DAVID W R.Molecular Cloning:A Laboratory Manual(ThirdEdition)[M].Cold Spring Harbor:CSHL Press,2002:483-485.
- [7]ZHANG A L,MA Y H,CHEN X M,et al.Genetic diversity and populationstructure of Indonesian native chickens based on single nucleotide poly-morphism markers[J].Poultry Science,2011,90(11):2471-2478.
- [8]黄邓萍,谢晓红,雷岷,等.利用微卫星标记研究鸭品种的遗传多样性[J].应用生学报,2009,20(1):190-196.
- [9]NEI M,TAJIMA F,TATENO Y.Accuracy of estimated phylogenetictreesfrom molecular data.II.Gene frequency data[J].Journal of Molecular Evo-lution,1983,19:153-170.
- [10]黄邓萍,谢晓红,雷岷,等.肉兔微卫星标记与生产性能的相关性研究[J].畜牧兽医杂志,2007,26(2):16-19.
- [11]张爱华.浅谈福建黄兔[J].畜牧兽医杂志,2004(6):41.
- [12]谢喜平,陈岩峰,孙世坤,等.福建黄兔微卫星标记的遗传多样性分析[J].福建农业学报,2008(3):239-243.
- [13]孙红梅,邢秀梅,荣敏,等.家兔遗传多样性及系统发生关系的微卫星分析[J].生物多样性,2008,16(5):492-497.